La longitud del enlace O-O en el peróxido es de aproximadamente 1,45 ｜, y el ángulo R-O-O (R=H, C) es de aproximadamente 110 ° (parecido al agua). Normalmente, el ángulo diedro de C-O-O-H es de unos 120 °. El enlace O-O es relativamente débil, y la energía de disociación del enlace es de 45-50 kcal/mol (190-210 kJ/mol), menos de la mitad de la fuerza de los enlaces C-C, C-H y C-O. El hidroperóxido suele ser más volátil que el alcohol correspondiente:
Alcohol tert-butílico (bp36 ° C) y alcohol tert-butílico (bp82-83 ° C)
CH3OOH (bp46 ° C) y CH3OH (bp65 ° C)
Hidroperóxido de isopropilbenceno (bp153 ° C) e isopropanol (bp202 ° C)
El hidroperóxido es débilmente ácido. El rango está representado por 11,5 de CH3OOH a 13,1 de Ph3COOH. El hidroperóxido puede reducirse a alcohol mediante el hidruro de litio y aluminio, como se describe en la siguiente ecuación idealizada 4ROOH+LiAlH4 → LiAlO2+2H2O+4ROH Esta reacción es la base del método de análisis de peróxidos orgánicos. Otro método para evaluar el contenido de perácido y peróxido es la valoración volumétrica con alcóxido, como el óxido de sodio. El éster de fosfito y la fosfina terciaria también desempeñan un papel reductor: ROOH+PR3 → OPR3+ROH